已发现的能用于生物湿法冶金的微生物有20余种，分别属于硫杆菌属(Thiobacillus),铁杆菌属(Ferrobacillus)嗜酸嗜热的硫叶菌属( Sulfolobus)和异养菌、真菌及醉母菌。现在用于工业上预氧化金矿石的细菌主要有四种，氧化铁硫杆菌( Thiobacillus Ferrooxdans,T. f) ,氧化硫硫杆菌(Thiobacillus Thiooxidans, T. t )、氧化铁铁杆菌(Ferrobacillus Ferroxidans , F. f )、氧化硫铁杆菌( Ferrobacillus Sulfooxidans, F. s )。优良菌种的获取是微生物技术的核心。这些细菌主要生长在金属硫化矿床和煤炭矿床的酸性矿水中，经过分离、筛选及驯化等培养步骤，可用于金属提取的湿法冶金中。